Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PXDC1Q5TGL8 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms