Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms