Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HSD17B12Q53GQ0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms