Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms