Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms