Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FHOD3Q2V2M9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHOD3Q2V2M9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHOD3Q2V2M9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHOD3Q2V2M9 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHOD3Q2V2M9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHOD3Q2V2M9 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHOD3Q2V2M9 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHOD3Q2V2M9 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHOD3Q2V2M9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms