Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GEN1Q17RS7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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