Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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