Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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TRIP13Q15645 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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TRIP13Q15645 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TRIP13Q15645 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TRIP13Q15645 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms