Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SYCP1Q15431 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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