Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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