Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
FAM53BQ14153 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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FAM53BQ14153 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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