Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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