Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms