Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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