Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH17Q12864 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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