Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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