Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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