Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms