Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGM3Q08188 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms