Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP1-1Q07627 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms