Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms