Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms