Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TYRO3Q06418 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms