Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNB3Q05901 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms