Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms