Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms