Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.5 ms