Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms