Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms