Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI35P80217 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI35P80217 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms