Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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