Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB10P61026 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB10P61026 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB10P61026 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms