Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC3P51654 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms