Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF6P49848 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms