Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HOXA1P49639 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms