Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms