Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NESP48681 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NESP48681 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NESP48681 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms