Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms