Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms