Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms