Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC1A2P43004 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms