Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms