Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPB2P35606 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPB2P35606 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPB2P35606 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPB2P35606 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPB2P35606 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms