Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms