Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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