Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms