Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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