Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BGNP21810 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BGNP21810 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms