Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCF3P15923 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCF3P15923 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF3P15923 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF3P15923 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCF3P15923 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms